Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms