Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2bP62915 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2bP62915 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2bP62915 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2bP62915 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2bP62915 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms