Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpfP62307 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms