Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps13P62301 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps13P62301 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms