Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl27P61358 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl27P61358 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl27P61358 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl27P61358 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl27P61358 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl27P61358 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl27P61358 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl27P61358 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms