Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms