Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms