Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf13P61216 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms