Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms