Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms