Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms