Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup43P59235 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup43P59235 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms