Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fermt1P59113 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fermt1P59113 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms