Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms