Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms