Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pex2P55098 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms