Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms