Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms