Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms