Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HccsP53702 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HccsP53702 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HccsP53702 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HccsP53702 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HccsP53702 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms