Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms