Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms