Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pold1P52431 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms