Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms