Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cxcl5P50228 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cxcl5P50228 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cxcl5P50228 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cxcl5P50228 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cxcl5P50228 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cxcl5P50228 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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