Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms