Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms