Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CenpcP49452 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpcP49452 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms