Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms