Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms