Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms