Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms