Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13P47963 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms