Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms