Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg3P47867 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms