Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkn1bP46414 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms