Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms