Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms