Protein–RNA interactions for Protein: P41731

Cd63, CD63 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd63P41731 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd63P41731 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms