Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc19a1P41438 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms