Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TfamP40630 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TfamP40630 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TfamP40630 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TfamP40630 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TfamP40630 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms