Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps26aP40336 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps26aP40336 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms