Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ThpoP40226 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms