Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf2P39429 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf2P39429 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms