Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms