Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpargP37238 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpargP37238 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpargP37238 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PpargP37238 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpargP37238 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpargP37238 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PpargP37238 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms