Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms