Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms