Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms