Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms